Viele Mitglieder der Agape Gemeinschaft sind gleichzeitig auch in der katholischen oder evangelischen Kirche. Das entspricht dem Selbstverständnis von Agape: Die Gemeinschaft schätzt den Reichtum der Vielfalt verschiedener christlicher Konfessionen, möchte auch anderen Kirchen dienen und von ihnen empfangen. Sie ist Mitglied der Evangelischen Allianz München und engagiert sich aktiv für den Dialog und die Zusammenarbeit mit allen anderen Kirchen und christlichen Gemeinden im Großraum München. Wie in den meisten christlichen Gemeinden lebt man bei Agape die Gemeinschaft auch praktisch, trifft sich zum Gottesdienst, in zahlreichen Hauskreisen und weiteren Arbeitsgruppen. Ein Schwerpunkt bei Agape ist auch Seelsorge, Gebet und Mentoring. Wichtig ist Agape auch die Durchführung von jährlich zwei Glaubensgrundkursen nach dem international verbreiteten Konzept „Alpha“, das in England von Pastor Nicky Gumbel entwickelt wurde. Agape versteht sich dabei als Multiplikator und veranstaltet einen jährlichen Trainingstag für andere Kirchen und Gemeinden, die eine Alpha-Arbeit starten wollen. Die Agape Gemeinschaft ist als gemeinnütziger Verein anerkannt. Geleitet wird sie von einem fünfköpfigen Vorstand, dem auch der Pastor Andreas Hardt angehört. Die zahlreichen Aktivitäten werden von den Menschen bei Agape größtenteils ehrenamtlich realisiert.
Die Agape Gemeinschaft hat kein eigenes Gebäude. Schon seit 40 Jahren findet der Gottesdienst jeden Freitagabend um 19 Uhr in der Ev.-Luth. Paul-Gerhard-Kirche in München Laim statt. Auch das Gemeindebüro befindet sich in den Gebäuden der Paul-Gerhard-Kirche.